Protein–RNA interactions for Protein: Q93074

MED12, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED12Q93074 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED12Q93074 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MED12Q93074 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MED12Q93074 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MED12Q93074 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED12Q93074 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MED12Q93074 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MED12Q93074 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED12Q93074 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MED12Q93074 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED12Q93074 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED12Q93074 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MED12Q93074 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED12Q93074 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED12Q93074 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED12Q93074 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MED12Q93074 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED12Q93074 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MED12Q93074 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED12Q93074 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MED12Q93074 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED12Q93074 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED12Q93074 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED12Q93074 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED12Q93074 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MED12Q93074 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MED12Q93074 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED12Q93074 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MED12Q93074 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED12Q93074 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED12Q93074 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MED12Q93074 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED12Q93074 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MED12Q93074 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED12Q93074 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED12Q93074 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MED12Q93074 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MED12Q93074 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
MED12Q93074 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED12Q93074 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MED12Q93074 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED12Q93074 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED12Q93074 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED12Q93074 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED12Q93074 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED12Q93074 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED12Q93074 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MED12Q93074 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MED12Q93074 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED12Q93074 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED12Q93074 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MED12Q93074 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED12Q93074 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED12Q93074 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED12Q93074 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MED12Q93074 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MED12Q93074 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MED12Q93074 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MED12Q93074 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED12Q93074 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED12Q93074 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED12Q93074 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED12Q93074 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED12Q93074 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MED12Q93074 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MED12Q93074 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED12Q93074 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MED12Q93074 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED12Q93074 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED12Q93074 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED12Q93074 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED12Q93074 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MED12Q93074 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED12Q93074 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED12Q93074 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MED12Q93074 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED12Q93074 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MED12Q93074 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MED12Q93074 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED12Q93074 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED12Q93074 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED12Q93074 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED12Q93074 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED12Q93074 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED12Q93074 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED12Q93074 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MED12Q93074 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MED12Q93074 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MED12Q93074 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED12Q93074 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MED12Q93074 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
MED12Q93074 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED12Q93074 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED12Q93074 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED12Q93074 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED12Q93074 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MED12Q93074 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED12Q93074 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED12Q93074 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MED12Q93074 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms