Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.65■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
P3H4Q92791 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
P3H4Q92791 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
P3H4Q92791 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
P3H4Q92791 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
P3H4Q92791 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
P3H4Q92791 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
P3H4Q92791 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.55■■■□□ 2
P3H4Q92791 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
P3H4Q92791 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
P3H4Q92791 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
P3H4Q92791 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P3H4Q92791 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
P3H4Q92791 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P3H4Q92791 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
P3H4Q92791 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
P3H4Q92791 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
P3H4Q92791 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
P3H4Q92791 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H4Q92791 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
P3H4Q92791 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H4Q92791 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H4Q92791 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
P3H4Q92791 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
P3H4Q92791 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
P3H4Q92791 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
P3H4Q92791 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
P3H4Q92791 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
P3H4Q92791 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
P3H4Q92791 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
P3H4Q92791 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
P3H4Q92791 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
P3H4Q92791 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
P3H4Q92791 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
P3H4Q92791 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H4Q92791 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H4Q92791 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
P3H4Q92791 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H4Q92791 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
P3H4Q92791 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H4Q92791 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H4Q92791 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
P3H4Q92791 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms