Protein–RNA interactions for Protein: Q92543

SNX19, Sorting nexin-19, humanhuman

Predictions only

Length 992 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX19Q92543 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SNX19Q92543 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX19Q92543 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SNX19Q92543 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX19Q92543 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SNX19Q92543 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SNX19Q92543 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SNX19Q92543 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SNX19Q92543 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX19Q92543 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SNX19Q92543 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SNX19Q92543 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SNX19Q92543 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SNX19Q92543 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SNX19Q92543 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX19Q92543 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX19Q92543 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SNX19Q92543 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SNX19Q92543 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SNX19Q92543 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX19Q92543 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SNX19Q92543 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SNX19Q92543 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SNX19Q92543 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SNX19Q92543 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms