Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMPDL3AQ92484 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMPDL3AQ92484 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMPDL3AQ92484 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMPDL3AQ92484 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMPDL3AQ92484 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMPDL3AQ92484 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMPDL3AQ92484 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SMPDL3AQ92484 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMPDL3AQ92484 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMPDL3AQ92484 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMPDL3AQ92484 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMPDL3AQ92484 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SMPDL3AQ92484 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMPDL3AQ92484 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMPDL3AQ92484 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMPDL3AQ92484 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMPDL3AQ92484 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPDL3AQ92484 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMPDL3AQ92484 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPDL3AQ92484 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPDL3AQ92484 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMPDL3AQ92484 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMPDL3AQ92484 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMPDL3AQ92484 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPDL3AQ92484 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMPDL3AQ92484 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPDL3AQ92484 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMPDL3AQ92484 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPDL3AQ92484 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPDL3AQ92484 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SMPDL3AQ92484 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPDL3AQ92484 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPDL3AQ92484 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPDL3AQ92484 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMPDL3AQ92484 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SMPDL3AQ92484 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMPDL3AQ92484 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMPDL3AQ92484 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPDL3AQ92484 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMPDL3AQ92484 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMPDL3AQ92484 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPDL3AQ92484 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPDL3AQ92484 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMPDL3AQ92484 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMPDL3AQ92484 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPDL3AQ92484 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPDL3AQ92484 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPDL3AQ92484 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMPDL3AQ92484 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMPDL3AQ92484 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMPDL3AQ92484 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMPDL3AQ92484 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMPDL3AQ92484 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMPDL3AQ92484 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMPDL3AQ92484 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMPDL3AQ92484 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SMPDL3AQ92484 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMPDL3AQ92484 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMPDL3AQ92484 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms