Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWZ7

ABCA5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCA5Q8WWZ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
ABCA5Q8WWZ7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
ABCA5Q8WWZ7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
ABCA5Q8WWZ7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC45.17■■■■■ 4.82
ABCA5Q8WWZ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
ABCA5Q8WWZ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
ABCA5Q8WWZ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
ABCA5Q8WWZ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
ABCA5Q8WWZ7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC45.15■■■■■ 4.82
ABCA5Q8WWZ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
ABCA5Q8WWZ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
ABCA5Q8WWZ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
ABCA5Q8WWZ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.81
ABCA5Q8WWZ7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCA5Q8WWZ7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCA5Q8WWZ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCA5Q8WWZ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCA5Q8WWZ7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCA5Q8WWZ7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCA5Q8WWZ7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCA5Q8WWZ7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
ABCA5Q8WWZ7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
ABCA5Q8WWZ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
ABCA5Q8WWZ7 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
ABCA5Q8WWZ7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
ABCA5Q8WWZ7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
ABCA5Q8WWZ7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCA5Q8WWZ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCA5Q8WWZ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC45■■■■■ 4.79
ABCA5Q8WWZ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
ABCA5Q8WWZ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
ABCA5Q8WWZ7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
ABCA5Q8WWZ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
ABCA5Q8WWZ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC44.98■■■■■ 4.79
ABCA5Q8WWZ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC44.96■■■■■ 4.79
ABCA5Q8WWZ7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
ABCA5Q8WWZ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.95■■■■■ 4.79
ABCA5Q8WWZ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC44.95■■■■■ 4.79
ABCA5Q8WWZ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
ABCA5Q8WWZ7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.78
ABCA5Q8WWZ7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.93■■■■■ 4.78
ABCA5Q8WWZ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
ABCA5Q8WWZ7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC44.91■■■■■ 4.78
ABCA5Q8WWZ7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
ABCA5Q8WWZ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
ABCA5Q8WWZ7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
ABCA5Q8WWZ7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
ABCA5Q8WWZ7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.9■■■■■ 4.78
ABCA5Q8WWZ7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
ABCA5Q8WWZ7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.77
ABCA5Q8WWZ7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.87■■■■■ 4.77
ABCA5Q8WWZ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.87■■■■■ 4.77
ABCA5Q8WWZ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
ABCA5Q8WWZ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
ABCA5Q8WWZ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
ABCA5Q8WWZ7 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC44.85■■■■■ 4.77
ABCA5Q8WWZ7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC44.85■■■■■ 4.77
ABCA5Q8WWZ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
ABCA5Q8WWZ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
ABCA5Q8WWZ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC44.82■■■■■ 4.77
ABCA5Q8WWZ7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
ABCA5Q8WWZ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC44.79■■■■■ 4.76
ABCA5Q8WWZ7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC44.79■■■■■ 4.76
ABCA5Q8WWZ7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
ABCA5Q8WWZ7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCA5Q8WWZ7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCA5Q8WWZ7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCA5Q8WWZ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC44.76■■■■■ 4.76
ABCA5Q8WWZ7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
ABCA5Q8WWZ7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC44.75■■■■■ 4.75
ABCA5Q8WWZ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
ABCA5Q8WWZ7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC44.72■■■■■ 4.75
ABCA5Q8WWZ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
ABCA5Q8WWZ7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC44.72■■■■■ 4.75
ABCA5Q8WWZ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
ABCA5Q8WWZ7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCA5Q8WWZ7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCA5Q8WWZ7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
ABCA5Q8WWZ7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.65■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
ABCA5Q8WWZ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
ABCA5Q8WWZ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
ABCA5Q8WWZ7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ABCA5Q8WWZ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ABCA5Q8WWZ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC44.61■■■■■ 4.73
ABCA5Q8WWZ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.6■■■■■ 4.73
ABCA5Q8WWZ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms