Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWQ0

PHIP, PH-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHIPQ8WWQ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PHIPQ8WWQ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PHIPQ8WWQ0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PHIPQ8WWQ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PHIPQ8WWQ0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PHIPQ8WWQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PHIPQ8WWQ0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PHIPQ8WWQ0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PHIPQ8WWQ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PHIPQ8WWQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
PHIPQ8WWQ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PHIPQ8WWQ0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PHIPQ8WWQ0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PHIPQ8WWQ0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PHIPQ8WWQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PHIPQ8WWQ0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PHIPQ8WWQ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PHIPQ8WWQ0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PHIPQ8WWQ0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PHIPQ8WWQ0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PHIPQ8WWQ0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PHIPQ8WWQ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
PHIPQ8WWQ0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PHIPQ8WWQ0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PHIPQ8WWQ0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PHIPQ8WWQ0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PHIPQ8WWQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PHIPQ8WWQ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PHIPQ8WWQ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PHIPQ8WWQ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PHIPQ8WWQ0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PHIPQ8WWQ0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
PHIPQ8WWQ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PHIPQ8WWQ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PHIPQ8WWQ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PHIPQ8WWQ0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PHIPQ8WWQ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PHIPQ8WWQ0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
PHIPQ8WWQ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PHIPQ8WWQ0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PHIPQ8WWQ0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PHIPQ8WWQ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PHIPQ8WWQ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PHIPQ8WWQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PHIPQ8WWQ0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PHIPQ8WWQ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PHIPQ8WWQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PHIPQ8WWQ0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PHIPQ8WWQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PHIPQ8WWQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PHIPQ8WWQ0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PHIPQ8WWQ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PHIPQ8WWQ0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PHIPQ8WWQ0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PHIPQ8WWQ0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PHIPQ8WWQ0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PHIPQ8WWQ0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PHIPQ8WWQ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PHIPQ8WWQ0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PHIPQ8WWQ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PHIPQ8WWQ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PHIPQ8WWQ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PHIPQ8WWQ0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PHIPQ8WWQ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PHIPQ8WWQ0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PHIPQ8WWQ0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PHIPQ8WWQ0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PHIPQ8WWQ0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PHIPQ8WWQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PHIPQ8WWQ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PHIPQ8WWQ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms