Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWH5

TRUB1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB1Q8WWH5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRUB1Q8WWH5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRUB1Q8WWH5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRUB1Q8WWH5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRUB1Q8WWH5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRUB1Q8WWH5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRUB1Q8WWH5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRUB1Q8WWH5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRUB1Q8WWH5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRUB1Q8WWH5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRUB1Q8WWH5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRUB1Q8WWH5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRUB1Q8WWH5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRUB1Q8WWH5 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRUB1Q8WWH5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRUB1Q8WWH5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRUB1Q8WWH5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRUB1Q8WWH5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRUB1Q8WWH5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRUB1Q8WWH5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRUB1Q8WWH5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRUB1Q8WWH5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRUB1Q8WWH5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRUB1Q8WWH5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRUB1Q8WWH5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRUB1Q8WWH5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRUB1Q8WWH5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRUB1Q8WWH5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRUB1Q8WWH5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRUB1Q8WWH5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms