Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW12

PCNP, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNPQ8WW12 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCNPQ8WW12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PCNPQ8WW12 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCNPQ8WW12 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PCNPQ8WW12 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNPQ8WW12 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PCNPQ8WW12 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PCNPQ8WW12 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNPQ8WW12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNPQ8WW12 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNPQ8WW12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PCNPQ8WW12 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PCNPQ8WW12 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNPQ8WW12 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PCNPQ8WW12 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PCNPQ8WW12 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PCNPQ8WW12 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PCNPQ8WW12 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNPQ8WW12 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PCNPQ8WW12 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCNPQ8WW12 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PCNPQ8WW12 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNPQ8WW12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNPQ8WW12 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PCNPQ8WW12 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNPQ8WW12 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCNPQ8WW12 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNPQ8WW12 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNPQ8WW12 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCNPQ8WW12 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PCNPQ8WW12 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNPQ8WW12 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNPQ8WW12 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNPQ8WW12 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNPQ8WW12 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNPQ8WW12 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCNPQ8WW12 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNPQ8WW12 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCNPQ8WW12 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNPQ8WW12 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNPQ8WW12 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCNPQ8WW12 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms