Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMBR1Q8WVP7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
LMBR1Q8WVP7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMBR1Q8WVP7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMBR1Q8WVP7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
LMBR1Q8WVP7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMBR1Q8WVP7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
LMBR1Q8WVP7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
LMBR1Q8WVP7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMBR1Q8WVP7 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
LMBR1Q8WVP7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMBR1Q8WVP7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMBR1Q8WVP7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
LMBR1Q8WVP7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMBR1Q8WVP7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
LMBR1Q8WVP7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMBR1Q8WVP7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
LMBR1Q8WVP7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMBR1Q8WVP7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
LMBR1Q8WVP7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
LMBR1Q8WVP7 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
LMBR1Q8WVP7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMBR1Q8WVP7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMBR1Q8WVP7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
LMBR1Q8WVP7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
LMBR1Q8WVP7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMBR1Q8WVP7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LMBR1Q8WVP7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
LMBR1Q8WVP7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMBR1Q8WVP7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMBR1Q8WVP7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
LMBR1Q8WVP7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMBR1Q8WVP7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
LMBR1Q8WVP7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
LMBR1Q8WVP7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMBR1Q8WVP7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMBR1Q8WVP7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMBR1Q8WVP7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMBR1Q8WVP7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMBR1Q8WVP7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMBR1Q8WVP7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMBR1Q8WVP7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMBR1Q8WVP7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMBR1Q8WVP7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMBR1Q8WVP7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMBR1Q8WVP7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMBR1Q8WVP7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMBR1Q8WVP7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMBR1Q8WVP7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms