Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH3RF2Q8TEC5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SH3RF2Q8TEC5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3RF2Q8TEC5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SH3RF2Q8TEC5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3RF2Q8TEC5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SH3RF2Q8TEC5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SH3RF2Q8TEC5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3RF2Q8TEC5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SH3RF2Q8TEC5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SH3RF2Q8TEC5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SH3RF2Q8TEC5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SH3RF2Q8TEC5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH3RF2Q8TEC5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH3RF2Q8TEC5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.51■■■□□ 2
SH3RF2Q8TEC5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SH3RF2Q8TEC5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms