Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF3IP1Q8TDR0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF3IP1Q8TDR0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAF3IP1Q8TDR0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAF3IP1Q8TDR0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF3IP1Q8TDR0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAF3IP1Q8TDR0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.56■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRAF3IP1Q8TDR0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TRAF3IP1Q8TDR0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRAF3IP1Q8TDR0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TRAF3IP1Q8TDR0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRAF3IP1Q8TDR0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms