Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDI0

CHD5, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD5Q8TDI0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHD5Q8TDI0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHD5Q8TDI0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHD5Q8TDI0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CHD5Q8TDI0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CHD5Q8TDI0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHD5Q8TDI0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHD5Q8TDI0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CHD5Q8TDI0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHD5Q8TDI0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHD5Q8TDI0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHD5Q8TDI0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHD5Q8TDI0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHD5Q8TDI0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHD5Q8TDI0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms