Protein–RNA interactions for Protein: Q8TCU5

GRIN3A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3AQ8TCU5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GRIN3AQ8TCU5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3AQ8TCU5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3AQ8TCU5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3AQ8TCU5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GRIN3AQ8TCU5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GRIN3AQ8TCU5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN3AQ8TCU5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN3AQ8TCU5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN3AQ8TCU5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN3AQ8TCU5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN3AQ8TCU5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN3AQ8TCU5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN3AQ8TCU5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN3AQ8TCU5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN3AQ8TCU5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN3AQ8TCU5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN3AQ8TCU5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN3AQ8TCU5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN3AQ8TCU5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN3AQ8TCU5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN3AQ8TCU5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN3AQ8TCU5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN3AQ8TCU5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN3AQ8TCU5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GRIN3AQ8TCU5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN3AQ8TCU5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN3AQ8TCU5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GRIN3AQ8TCU5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIN3AQ8TCU5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIN3AQ8TCU5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GRIN3AQ8TCU5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GRIN3AQ8TCU5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GRIN3AQ8TCU5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms