Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM71BQ8TC56 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM71BQ8TC56 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM71BQ8TC56 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM71BQ8TC56 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM71BQ8TC56 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM71BQ8TC56 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM71BQ8TC56 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM71BQ8TC56 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM71BQ8TC56 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM71BQ8TC56 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
FAM71BQ8TC56 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM71BQ8TC56 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM71BQ8TC56 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FAM71BQ8TC56 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FAM71BQ8TC56 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM71BQ8TC56 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FAM71BQ8TC56 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM71BQ8TC56 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM71BQ8TC56 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM71BQ8TC56 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FAM71BQ8TC56 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM71BQ8TC56 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FAM71BQ8TC56 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FAM71BQ8TC56 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM71BQ8TC56 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FAM71BQ8TC56 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM71BQ8TC56 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM71BQ8TC56 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FAM71BQ8TC56 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM71BQ8TC56 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM71BQ8TC56 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM71BQ8TC56 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FAM71BQ8TC56 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
FAM71BQ8TC56 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM71BQ8TC56 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FAM71BQ8TC56 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
FAM71BQ8TC56 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM71BQ8TC56 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM71BQ8TC56 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM71BQ8TC56 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FAM71BQ8TC56 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM71BQ8TC56 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM71BQ8TC56 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
FAM71BQ8TC56 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM71BQ8TC56 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM71BQ8TC56 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM71BQ8TC56 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FAM71BQ8TC56 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FAM71BQ8TC56 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms