Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAA9

VANGL1, Vang-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VANGL1Q8TAA9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VANGL1Q8TAA9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VANGL1Q8TAA9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VANGL1Q8TAA9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VANGL1Q8TAA9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
VANGL1Q8TAA9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VANGL1Q8TAA9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
VANGL1Q8TAA9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VANGL1Q8TAA9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VANGL1Q8TAA9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VANGL1Q8TAA9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VANGL1Q8TAA9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VANGL1Q8TAA9 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VANGL1Q8TAA9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VANGL1Q8TAA9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VANGL1Q8TAA9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VANGL1Q8TAA9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VANGL1Q8TAA9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VANGL1Q8TAA9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VANGL1Q8TAA9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VANGL1Q8TAA9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VANGL1Q8TAA9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VANGL1Q8TAA9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VANGL1Q8TAA9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VANGL1Q8TAA9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VANGL1Q8TAA9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VANGL1Q8TAA9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VANGL1Q8TAA9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VANGL1Q8TAA9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VANGL1Q8TAA9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VANGL1Q8TAA9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VANGL1Q8TAA9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VANGL1Q8TAA9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VANGL1Q8TAA9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VANGL1Q8TAA9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
VANGL1Q8TAA9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VANGL1Q8TAA9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VANGL1Q8TAA9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VANGL1Q8TAA9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VANGL1Q8TAA9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VANGL1Q8TAA9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VANGL1Q8TAA9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VANGL1Q8TAA9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VANGL1Q8TAA9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VANGL1Q8TAA9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
VANGL1Q8TAA9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VANGL1Q8TAA9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VANGL1Q8TAA9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms