Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV9

RHOXF1, Rhox homeobox family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF1Q8NHV9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHOXF1Q8NHV9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHOXF1Q8NHV9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOXF1Q8NHV9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHOXF1Q8NHV9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOXF1Q8NHV9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOXF1Q8NHV9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOXF1Q8NHV9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHOXF1Q8NHV9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOXF1Q8NHV9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOXF1Q8NHV9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHOXF1Q8NHV9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOXF1Q8NHV9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHOXF1Q8NHV9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF1Q8NHV9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RHOXF1Q8NHV9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RHOXF1Q8NHV9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RHOXF1Q8NHV9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RHOXF1Q8NHV9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF1Q8NHV9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RHOXF1Q8NHV9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOXF1Q8NHV9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOXF1Q8NHV9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RHOXF1Q8NHV9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF1Q8NHV9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF1Q8NHV9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHOXF1Q8NHV9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF1Q8NHV9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHOXF1Q8NHV9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RHOXF1Q8NHV9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHOXF1Q8NHV9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms