Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFJ8

BHLHE22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE22Q8NFJ8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHLHE22Q8NFJ8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHLHE22Q8NFJ8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BHLHE22Q8NFJ8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BHLHE22Q8NFJ8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BHLHE22Q8NFJ8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BHLHE22Q8NFJ8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHLHE22Q8NFJ8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BHLHE22Q8NFJ8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BHLHE22Q8NFJ8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BHLHE22Q8NFJ8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
BHLHE22Q8NFJ8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHLHE22Q8NFJ8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BHLHE22Q8NFJ8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BHLHE22Q8NFJ8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BHLHE22Q8NFJ8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BHLHE22Q8NFJ8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BHLHE22Q8NFJ8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BHLHE22Q8NFJ8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms