Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID1BQ8NFD5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
ARID1BQ8NFD5 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ARID1BQ8NFD5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ARID1BQ8NFD5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID1BQ8NFD5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID1BQ8NFD5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID1BQ8NFD5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ARID1BQ8NFD5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID1BQ8NFD5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ARID1BQ8NFD5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ARID1BQ8NFD5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID1BQ8NFD5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID1BQ8NFD5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ARID1BQ8NFD5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ARID1BQ8NFD5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ARID1BQ8NFD5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ARID1BQ8NFD5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ARID1BQ8NFD5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID1BQ8NFD5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID1BQ8NFD5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ARID1BQ8NFD5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID1BQ8NFD5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID1BQ8NFD5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID1BQ8NFD5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ARID1BQ8NFD5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ARID1BQ8NFD5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ARID1BQ8NFD5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARID1BQ8NFD5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms