Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEZ2

VPS37A, Vacuolar protein sorting-associated protein 37A, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37AQ8NEZ2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VPS37AQ8NEZ2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37AQ8NEZ2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VPS37AQ8NEZ2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37AQ8NEZ2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
VPS37AQ8NEZ2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS37AQ8NEZ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS37AQ8NEZ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
VPS37AQ8NEZ2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
VPS37AQ8NEZ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS37AQ8NEZ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
VPS37AQ8NEZ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
VPS37AQ8NEZ2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37AQ8NEZ2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37AQ8NEZ2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
VPS37AQ8NEZ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VPS37AQ8NEZ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
VPS37AQ8NEZ2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37AQ8NEZ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VPS37AQ8NEZ2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37AQ8NEZ2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37AQ8NEZ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VPS37AQ8NEZ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VPS37AQ8NEZ2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37AQ8NEZ2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37AQ8NEZ2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VPS37AQ8NEZ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS37AQ8NEZ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS37AQ8NEZ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS37AQ8NEZ2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS37AQ8NEZ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS37AQ8NEZ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37AQ8NEZ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37AQ8NEZ2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS37AQ8NEZ2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS37AQ8NEZ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37AQ8NEZ2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37AQ8NEZ2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37AQ8NEZ2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS37AQ8NEZ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37AQ8NEZ2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37AQ8NEZ2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS37AQ8NEZ2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37AQ8NEZ2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VPS37AQ8NEZ2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37AQ8NEZ2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37AQ8NEZ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VPS37AQ8NEZ2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37AQ8NEZ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37AQ8NEZ2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
VPS37AQ8NEZ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VPS37AQ8NEZ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37AQ8NEZ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
VPS37AQ8NEZ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
VPS37AQ8NEZ2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms