Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FAM46DQ8NEK8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FAM46DQ8NEK8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM46DQ8NEK8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM46DQ8NEK8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FAM46DQ8NEK8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM46DQ8NEK8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FAM46DQ8NEK8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM46DQ8NEK8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM46DQ8NEK8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM46DQ8NEK8 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FAM46DQ8NEK8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM46DQ8NEK8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FAM46DQ8NEK8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM46DQ8NEK8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FAM46DQ8NEK8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FAM46DQ8NEK8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FAM46DQ8NEK8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM46DQ8NEK8 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM46DQ8NEK8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM46DQ8NEK8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM46DQ8NEK8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FAM46DQ8NEK8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FAM46DQ8NEK8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM46DQ8NEK8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM46DQ8NEK8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FAM46DQ8NEK8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM46DQ8NEK8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
FAM46DQ8NEK8 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
FAM46DQ8NEK8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
FAM46DQ8NEK8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 309.6 ms