Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF548Q8NEK5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF548Q8NEK5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF548Q8NEK5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ZNF548Q8NEK5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF548Q8NEK5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF548Q8NEK5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF548Q8NEK5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZNF548Q8NEK5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZNF548Q8NEK5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF548Q8NEK5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF548Q8NEK5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ZNF548Q8NEK5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
ZNF548Q8NEK5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ZNF548Q8NEK5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ZNF548Q8NEK5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ZNF548Q8NEK5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ZNF548Q8NEK5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
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