Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF439Q8NDP4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF439Q8NDP4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ZNF439Q8NDP4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ZNF439Q8NDP4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ZNF439Q8NDP4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms