Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7R7

CCNYL1, Cyclin-Y-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNYL1Q8N7R7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCNYL1Q8N7R7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNYL1Q8N7R7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNYL1Q8N7R7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNYL1Q8N7R7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCNYL1Q8N7R7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNYL1Q8N7R7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNYL1Q8N7R7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNYL1Q8N7R7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCNYL1Q8N7R7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCNYL1Q8N7R7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNYL1Q8N7R7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNYL1Q8N7R7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCNYL1Q8N7R7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNYL1Q8N7R7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNYL1Q8N7R7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCNYL1Q8N7R7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNYL1Q8N7R7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNYL1Q8N7R7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCNYL1Q8N7R7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCNYL1Q8N7R7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCNYL1Q8N7R7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CCNYL1Q8N7R7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCNYL1Q8N7R7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNYL1Q8N7R7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCNYL1Q8N7R7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNYL1Q8N7R7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNYL1Q8N7R7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNYL1Q8N7R7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNYL1Q8N7R7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCNYL1Q8N7R7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCNYL1Q8N7R7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNYL1Q8N7R7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCNYL1Q8N7R7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCNYL1Q8N7R7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCNYL1Q8N7R7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNYL1Q8N7R7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNYL1Q8N7R7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCNYL1Q8N7R7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNYL1Q8N7R7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCNYL1Q8N7R7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNYL1Q8N7R7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCNYL1Q8N7R7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CCNYL1Q8N7R7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCNYL1Q8N7R7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCNYL1Q8N7R7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCNYL1Q8N7R7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CCNYL1Q8N7R7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CCNYL1Q8N7R7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CCNYL1Q8N7R7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CCNYL1Q8N7R7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CCNYL1Q8N7R7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms