Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN22Q8N7P3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLDN22Q8N7P3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN22Q8N7P3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLDN22Q8N7P3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN22Q8N7P3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLDN22Q8N7P3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLDN22Q8N7P3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN22Q8N7P3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN22Q8N7P3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN22Q8N7P3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLDN22Q8N7P3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLDN22Q8N7P3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLDN22Q8N7P3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN22Q8N7P3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN22Q8N7P3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLDN22Q8N7P3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLDN22Q8N7P3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN22Q8N7P3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN22Q8N7P3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLDN22Q8N7P3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN22Q8N7P3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN22Q8N7P3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN22Q8N7P3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLDN22Q8N7P3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN22Q8N7P3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLDN22Q8N7P3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN22Q8N7P3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLDN22Q8N7P3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLDN22Q8N7P3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CLDN22Q8N7P3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CLDN22Q8N7P3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN22Q8N7P3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN22Q8N7P3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CLDN22Q8N7P3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CLDN22Q8N7P3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CLDN22Q8N7P3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLDN22Q8N7P3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CLDN22Q8N7P3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms