Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSGALNACT2Q8N6G5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CSGALNACT2Q8N6G5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSGALNACT2Q8N6G5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CSGALNACT2Q8N6G5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CSGALNACT2Q8N6G5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CSGALNACT2Q8N6G5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSGALNACT2Q8N6G5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSGALNACT2Q8N6G5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CSGALNACT2Q8N6G5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CSGALNACT2Q8N6G5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
CSGALNACT2Q8N6G5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSGALNACT2Q8N6G5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CSGALNACT2Q8N6G5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CSGALNACT2Q8N6G5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CSGALNACT2Q8N6G5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CSGALNACT2Q8N6G5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSGALNACT2Q8N6G5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSGALNACT2Q8N6G5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CSGALNACT2Q8N6G5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSGALNACT2Q8N6G5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CSGALNACT2Q8N6G5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CSGALNACT2Q8N6G5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CSGALNACT2Q8N6G5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CSGALNACT2Q8N6G5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CSGALNACT2Q8N6G5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CSGALNACT2Q8N6G5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CSGALNACT2Q8N6G5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms