Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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