Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FAM71E2Q8N5Q1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FAM71E2Q8N5Q1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FAM71E2Q8N5Q1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM71E2Q8N5Q1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM71E2Q8N5Q1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms