Protein–RNA interactions for Protein: Q8N535

LINC00471, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00471, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00471Q8N535 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00471Q8N535 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00471Q8N535 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LINC00471Q8N535 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC00471Q8N535 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC00471Q8N535 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00471Q8N535 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00471Q8N535 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC00471Q8N535 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC00471Q8N535 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC00471Q8N535 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC00471Q8N535 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC00471Q8N535 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC00471Q8N535 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC00471Q8N535 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LINC00471Q8N535 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LINC00471Q8N535 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00471Q8N535 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00471Q8N535 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00471Q8N535 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LINC00471Q8N535 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00471Q8N535 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LINC00471Q8N535 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00471Q8N535 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LINC00471Q8N535 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LINC00471Q8N535 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LINC00471Q8N535 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LINC00471Q8N535 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00471Q8N535 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00471Q8N535 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00471Q8N535 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00471Q8N535 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
LINC00471Q8N535 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00471Q8N535 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00471Q8N535 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00471Q8N535 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LINC00471Q8N535 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00471Q8N535 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LINC00471Q8N535 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms