Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SVOPQ8N4V2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SVOPQ8N4V2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SVOPQ8N4V2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SVOPQ8N4V2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SVOPQ8N4V2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SVOPQ8N4V2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SVOPQ8N4V2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SVOPQ8N4V2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SVOPQ8N4V2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SVOPQ8N4V2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SVOPQ8N4V2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SVOPQ8N4V2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SVOPQ8N4V2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SVOPQ8N4V2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SVOPQ8N4V2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SVOPQ8N4V2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SVOPQ8N4V2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SVOPQ8N4V2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SVOPQ8N4V2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SVOPQ8N4V2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms