Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4N3

KLHL36, Kelch-like protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL36Q8N4N3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
KLHL36Q8N4N3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KLHL36Q8N4N3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL36Q8N4N3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
KLHL36Q8N4N3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL36Q8N4N3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KLHL36Q8N4N3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KLHL36Q8N4N3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KLHL36Q8N4N3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
KLHL36Q8N4N3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KLHL36Q8N4N3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KLHL36Q8N4N3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL36Q8N4N3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KLHL36Q8N4N3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL36Q8N4N3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL36Q8N4N3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KLHL36Q8N4N3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL36Q8N4N3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL36Q8N4N3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL36Q8N4N3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KLHL36Q8N4N3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL36Q8N4N3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL36Q8N4N3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL36Q8N4N3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL36Q8N4N3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KLHL36Q8N4N3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms