Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
LTBP4Q8N2S1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
LTBP4Q8N2S1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
LTBP4Q8N2S1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC39■■■■□ 3.83
LTBP4Q8N2S1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.99■■■■□ 3.83
LTBP4Q8N2S1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC38.99■■■■□ 3.83
LTBP4Q8N2S1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
LTBP4Q8N2S1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
LTBP4Q8N2S1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
LTBP4Q8N2S1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
LTBP4Q8N2S1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
LTBP4Q8N2S1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.94■■■■□ 3.82
LTBP4Q8N2S1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
LTBP4Q8N2S1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
LTBP4Q8N2S1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
LTBP4Q8N2S1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
LTBP4Q8N2S1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
LTBP4Q8N2S1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
LTBP4Q8N2S1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
LTBP4Q8N2S1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
LTBP4Q8N2S1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
LTBP4Q8N2S1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC38.87■■■■□ 3.81
LTBP4Q8N2S1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC38.87■■■■□ 3.81
LTBP4Q8N2S1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
LTBP4Q8N2S1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
LTBP4Q8N2S1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
LTBP4Q8N2S1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
LTBP4Q8N2S1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
LTBP4Q8N2S1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
LTBP4Q8N2S1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
LTBP4Q8N2S1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
LTBP4Q8N2S1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.8■■■■□ 3.8
LTBP4Q8N2S1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
LTBP4Q8N2S1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
LTBP4Q8N2S1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
LTBP4Q8N2S1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.77■■■■□ 3.8
LTBP4Q8N2S1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
LTBP4Q8N2S1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
LTBP4Q8N2S1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
LTBP4Q8N2S1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.69■■■■□ 3.78
LTBP4Q8N2S1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
LTBP4Q8N2S1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
LTBP4Q8N2S1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
LTBP4Q8N2S1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
LTBP4Q8N2S1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC38.65■■■■□ 3.78
LTBP4Q8N2S1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
LTBP4Q8N2S1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
LTBP4Q8N2S1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
LTBP4Q8N2S1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
LTBP4Q8N2S1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
LTBP4Q8N2S1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
LTBP4Q8N2S1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
LTBP4Q8N2S1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
LTBP4Q8N2S1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.56■■■■□ 3.76
LTBP4Q8N2S1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
LTBP4Q8N2S1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
LTBP4Q8N2S1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
LTBP4Q8N2S1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.55■■■■□ 3.76
LTBP4Q8N2S1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
LTBP4Q8N2S1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
LTBP4Q8N2S1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.49■■■■□ 3.75
LTBP4Q8N2S1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
LTBP4Q8N2S1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
LTBP4Q8N2S1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
LTBP4Q8N2S1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC38.47■■■■□ 3.75
LTBP4Q8N2S1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
LTBP4Q8N2S1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
LTBP4Q8N2S1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
LTBP4Q8N2S1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
LTBP4Q8N2S1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
LTBP4Q8N2S1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms