Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CA13Q8N1Q1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CA13Q8N1Q1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA13Q8N1Q1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CA13Q8N1Q1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA13Q8N1Q1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CA13Q8N1Q1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CA13Q8N1Q1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CA13Q8N1Q1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CA13Q8N1Q1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CA13Q8N1Q1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CA13Q8N1Q1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CA13Q8N1Q1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA13Q8N1Q1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA13Q8N1Q1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA13Q8N1Q1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA13Q8N1Q1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CA13Q8N1Q1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA13Q8N1Q1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CA13Q8N1Q1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA13Q8N1Q1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA13Q8N1Q1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CA13Q8N1Q1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CA13Q8N1Q1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CA13Q8N1Q1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CA13Q8N1Q1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CA13Q8N1Q1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CA13Q8N1Q1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CA13Q8N1Q1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CA13Q8N1Q1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CA13Q8N1Q1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CA13Q8N1Q1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CA13Q8N1Q1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CA13Q8N1Q1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CA13Q8N1Q1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CA13Q8N1Q1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CA13Q8N1Q1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CA13Q8N1Q1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CA13Q8N1Q1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
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