Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU1

FAM9A, Protein FAM9A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM9AQ8IZU1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.43■■■■■ 4.7
FAM9AQ8IZU1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC44.43■■■■■ 4.7
FAM9AQ8IZU1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
FAM9AQ8IZU1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
FAM9AQ8IZU1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC44.41■■■■■ 4.7
FAM9AQ8IZU1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC44.41■■■■■ 4.7
FAM9AQ8IZU1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.4■■■■■ 4.7
FAM9AQ8IZU1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC44.39■■■■■ 4.7
FAM9AQ8IZU1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.38■■■■■ 4.69
FAM9AQ8IZU1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
FAM9AQ8IZU1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC44.37■■■■■ 4.69
FAM9AQ8IZU1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
FAM9AQ8IZU1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.36■■■■■ 4.69
FAM9AQ8IZU1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
FAM9AQ8IZU1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
FAM9AQ8IZU1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.33■■■■■ 4.69
FAM9AQ8IZU1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
FAM9AQ8IZU1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.69
FAM9AQ8IZU1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC44.31■■■■■ 4.68
FAM9AQ8IZU1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
FAM9AQ8IZU1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
FAM9AQ8IZU1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
FAM9AQ8IZU1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.29■■■■■ 4.68
FAM9AQ8IZU1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
FAM9AQ8IZU1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC44.28■■■■■ 4.68
FAM9AQ8IZU1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
FAM9AQ8IZU1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC44.28■■■■■ 4.68
FAM9AQ8IZU1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC44.28■■■■■ 4.68
FAM9AQ8IZU1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC44.25■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.25■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC44.24■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC44.22■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.22■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC44.21■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC44.21■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.21■■■■■ 4.67
FAM9AQ8IZU1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
FAM9AQ8IZU1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.18■■■■■ 4.66
FAM9AQ8IZU1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
FAM9AQ8IZU1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.16■■■■■ 4.66
FAM9AQ8IZU1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
FAM9AQ8IZU1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC44.14■■■■■ 4.66
FAM9AQ8IZU1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.13■■■■■ 4.66
FAM9AQ8IZU1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC44.12■■■■■ 4.65
FAM9AQ8IZU1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC44.12■■■■■ 4.65
FAM9AQ8IZU1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
FAM9AQ8IZU1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
FAM9AQ8IZU1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC44.1■■■■■ 4.65
FAM9AQ8IZU1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC44.1■■■■■ 4.65
FAM9AQ8IZU1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
FAM9AQ8IZU1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC44.09■■■■■ 4.65
FAM9AQ8IZU1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.06■■■■■ 4.64
FAM9AQ8IZU1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
FAM9AQ8IZU1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
FAM9AQ8IZU1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC44.05■■■■■ 4.64
FAM9AQ8IZU1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
FAM9AQ8IZU1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
FAM9AQ8IZU1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
FAM9AQ8IZU1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
FAM9AQ8IZU1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
FAM9AQ8IZU1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC44.01■■■■■ 4.64
FAM9AQ8IZU1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
FAM9AQ8IZU1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC43.98■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.97■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.96■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.63
FAM9AQ8IZU1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
FAM9AQ8IZU1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.93■■■■■ 4.62
FAM9AQ8IZU1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.92■■■■■ 4.62
FAM9AQ8IZU1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
FAM9AQ8IZU1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
FAM9AQ8IZU1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
FAM9AQ8IZU1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
FAM9AQ8IZU1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
FAM9AQ8IZU1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
FAM9AQ8IZU1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.89■■■■■ 4.62
FAM9AQ8IZU1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC43.88■■■■■ 4.62
FAM9AQ8IZU1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.61
FAM9AQ8IZU1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
FAM9AQ8IZU1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC43.87■■■■■ 4.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms