Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RIMKLAQ8IXN7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RIMKLAQ8IXN7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIMKLAQ8IXN7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RIMKLAQ8IXN7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
RIMKLAQ8IXN7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RIMKLAQ8IXN7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIMKLAQ8IXN7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIMKLAQ8IXN7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RIMKLAQ8IXN7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMKLAQ8IXN7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMKLAQ8IXN7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RIMKLAQ8IXN7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RIMKLAQ8IXN7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMKLAQ8IXN7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RIMKLAQ8IXN7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMKLAQ8IXN7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RIMKLAQ8IXN7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RIMKLAQ8IXN7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RIMKLAQ8IXN7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RIMKLAQ8IXN7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMKLAQ8IXN7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMKLAQ8IXN7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RIMKLAQ8IXN7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMKLAQ8IXN7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RIMKLAQ8IXN7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMKLAQ8IXN7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMKLAQ8IXN7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMKLAQ8IXN7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMKLAQ8IXN7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RIMKLAQ8IXN7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMKLAQ8IXN7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RIMKLAQ8IXN7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RIMKLAQ8IXN7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMKLAQ8IXN7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RIMKLAQ8IXN7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMKLAQ8IXN7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMKLAQ8IXN7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RIMKLAQ8IXN7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RIMKLAQ8IXN7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIMKLAQ8IXN7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIMKLAQ8IXN7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIMKLAQ8IXN7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIMKLAQ8IXN7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RIMKLAQ8IXN7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RIMKLAQ8IXN7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIMKLAQ8IXN7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIMKLAQ8IXN7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms