Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHERPQ8IWX8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHERPQ8IWX8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHERPQ8IWX8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHERPQ8IWX8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CHERPQ8IWX8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CHERPQ8IWX8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHERPQ8IWX8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHERPQ8IWX8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CHERPQ8IWX8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHERPQ8IWX8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHERPQ8IWX8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHERPQ8IWX8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CHERPQ8IWX8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHERPQ8IWX8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CHERPQ8IWX8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHERPQ8IWX8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHERPQ8IWX8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHERPQ8IWX8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHERPQ8IWX8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHERPQ8IWX8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHERPQ8IWX8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHERPQ8IWX8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms