Protein–RNA interactions for Protein: Q86X29

LSR, Lipolysis-stimulated lipoprotein receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSRQ86X29 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LSRQ86X29 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LSRQ86X29 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LSRQ86X29 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LSRQ86X29 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LSRQ86X29 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSRQ86X29 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LSRQ86X29 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSRQ86X29 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LSRQ86X29 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSRQ86X29 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LSRQ86X29 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSRQ86X29 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSRQ86X29 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LSRQ86X29 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LSRQ86X29 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LSRQ86X29 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
LSRQ86X29 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSRQ86X29 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSRQ86X29 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LSRQ86X29 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSRQ86X29 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSRQ86X29 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LSRQ86X29 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSRQ86X29 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LSRQ86X29 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LSRQ86X29 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LSRQ86X29 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LSRQ86X29 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LSRQ86X29 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LSRQ86X29 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms