Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SKAP1Q86WV1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SKAP1Q86WV1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SKAP1Q86WV1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SKAP1Q86WV1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SKAP1Q86WV1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SKAP1Q86WV1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SKAP1Q86WV1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
SKAP1Q86WV1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SKAP1Q86WV1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms