Protein–RNA interactions for Protein: Q86WI0

LHFPL1, LHFPL tetraspan subfamily member 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL1Q86WI0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHFPL1Q86WI0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHFPL1Q86WI0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LHFPL1Q86WI0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LHFPL1Q86WI0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHFPL1Q86WI0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHFPL1Q86WI0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHFPL1Q86WI0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LHFPL1Q86WI0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LHFPL1Q86WI0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LHFPL1Q86WI0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LHFPL1Q86WI0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
LHFPL1Q86WI0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LHFPL1Q86WI0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHFPL1Q86WI0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LHFPL1Q86WI0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHFPL1Q86WI0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LHFPL1Q86WI0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LHFPL1Q86WI0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHFPL1Q86WI0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHFPL1Q86WI0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHFPL1Q86WI0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LHFPL1Q86WI0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LHFPL1Q86WI0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LHFPL1Q86WI0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LHFPL1Q86WI0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LHFPL1Q86WI0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL1Q86WI0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL1Q86WI0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL1Q86WI0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL1Q86WI0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LHFPL1Q86WI0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHFPL1Q86WI0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LHFPL1Q86WI0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LHFPL1Q86WI0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHFPL1Q86WI0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LHFPL1Q86WI0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LHFPL1Q86WI0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms