Protein–RNA interactions for Protein: Q86T20

SMIM29, Uncharacterized protein SMIM29, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM29Q86T20 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SMIM29Q86T20 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMIM29Q86T20 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMIM29Q86T20 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMIM29Q86T20 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms