Protein–RNA interactions for Protein: Q86SJ6

DSG4, Desmoglein-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG4Q86SJ6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
DSG4Q86SJ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
DSG4Q86SJ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
DSG4Q86SJ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSG4Q86SJ6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSG4Q86SJ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DSG4Q86SJ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DSG4Q86SJ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
DSG4Q86SJ6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DSG4Q86SJ6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSG4Q86SJ6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DSG4Q86SJ6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSG4Q86SJ6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSG4Q86SJ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DSG4Q86SJ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
DSG4Q86SJ6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DSG4Q86SJ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG4Q86SJ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG4Q86SJ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG4Q86SJ6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG4Q86SJ6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DSG4Q86SJ6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DSG4Q86SJ6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DSG4Q86SJ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DSG4Q86SJ6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DSG4Q86SJ6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG4Q86SJ6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG4Q86SJ6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG4Q86SJ6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DSG4Q86SJ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms