Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7H5

TMED4, Transmembrane emp24 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED4Q7Z7H5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TMED4Q7Z7H5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMED4Q7Z7H5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMED4Q7Z7H5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED4Q7Z7H5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMED4Q7Z7H5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED4Q7Z7H5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED4Q7Z7H5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMED4Q7Z7H5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED4Q7Z7H5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED4Q7Z7H5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMED4Q7Z7H5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED4Q7Z7H5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED4Q7Z7H5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMED4Q7Z7H5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED4Q7Z7H5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMED4Q7Z7H5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMED4Q7Z7H5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED4Q7Z7H5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED4Q7Z7H5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED4Q7Z7H5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMED4Q7Z7H5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMED4Q7Z7H5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms