Protein–RNA interactions for Protein: Q7L5N7

LPCAT2, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPCAT2Q7L5N7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LPCAT2Q7L5N7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LPCAT2Q7L5N7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
LPCAT2Q7L5N7 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LPCAT2Q7L5N7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LPCAT2Q7L5N7 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPCAT2Q7L5N7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LPCAT2Q7L5N7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LPCAT2Q7L5N7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LPCAT2Q7L5N7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LPCAT2Q7L5N7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LPCAT2Q7L5N7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LPCAT2Q7L5N7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LPCAT2Q7L5N7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
LPCAT2Q7L5N7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LPCAT2Q7L5N7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LPCAT2Q7L5N7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LPCAT2Q7L5N7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LPCAT2Q7L5N7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LPCAT2Q7L5N7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LPCAT2Q7L5N7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LPCAT2Q7L5N7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LPCAT2Q7L5N7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LPCAT2Q7L5N7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LPCAT2Q7L5N7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LPCAT2Q7L5N7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LPCAT2Q7L5N7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LPCAT2Q7L5N7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LPCAT2Q7L5N7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LPCAT2Q7L5N7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LPCAT2Q7L5N7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LPCAT2Q7L5N7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LPCAT2Q7L5N7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LPCAT2Q7L5N7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LPCAT2Q7L5N7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LPCAT2Q7L5N7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LPCAT2Q7L5N7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LPCAT2Q7L5N7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LPCAT2Q7L5N7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LPCAT2Q7L5N7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LPCAT2Q7L5N7 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms