Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHST9Q7L1S5 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CHST9Q7L1S5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST9Q7L1S5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CHST9Q7L1S5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHST9Q7L1S5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CHST9Q7L1S5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST9Q7L1S5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CHST9Q7L1S5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CHST9Q7L1S5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST9Q7L1S5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST9Q7L1S5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CHST9Q7L1S5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CHST9Q7L1S5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHST9Q7L1S5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHST9Q7L1S5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHST9Q7L1S5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHST9Q7L1S5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHST9Q7L1S5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHST9Q7L1S5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHST9Q7L1S5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHST9Q7L1S5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHST9Q7L1S5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHST9Q7L1S5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHST9Q7L1S5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHST9Q7L1S5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHST9Q7L1S5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHST9Q7L1S5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CHST9Q7L1S5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CHST9Q7L1S5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms