Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC2

LARP4, La-related protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 724 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP4Q71RC2 ACSF3-218ENST00000614302 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 ACSF3-207ENST00000537155 848 ntTSL 212.07□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 ELOA-203ENST00000609199 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 KARS-204ENST00000564578 1942 ntTSL 511.74□□□□□ -0.534e-12■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 TTLL9-209ENST00000616761 1808 ntTSL 511.49□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 TTLL9-203ENST00000375922 1861 ntTSL 1 (best)11.42□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 ACSF3-203ENST00000393145 7020 nt10.98□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 HERC1-214ENST00000561400 2215 ntTSL 210.98□□□□□ -0.652e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 TTLL9-201ENST00000310998 1540 ntTSL 1 (best)10.63□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 DIAPH1-211ENST00000518047 4668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.774e-10■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 SH3BGRL-202ENST00000463546 755 ntTSL 29.16□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 SH3BGRL-203ENST00000474113 739 ntTSL 39.16□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 ACSF3-205ENST00000535176 421 ntTSL 39.15□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 KARS-202ENST00000319410 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.974e-12■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 SH3BGRL-204ENST00000481106 928 ntTSL 1 (best)8.73□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 HERC1-209ENST00000560519 591 ntTSL 38.68□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 TTLL9-206ENST00000535842 3261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.66□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MIR4435-2HG-220ENST00000609902 603 ntTSL 3 BASIC8.57□□□□□ -1.042e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 KARS-209ENST00000568378 459 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.064e-12■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 TTLL9-211ENST00000620043 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.122e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 PRKCA-201ENST00000284384 2718 ntTSL 57.77□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.172e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MIR4435-2HG-205ENST00000431385 843 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MIR4435-2HG-211ENST00000443467 826 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.232e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.252e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.262e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 SNHG8-203ENST00000602520 327 ntTSL 26.75□□□□□ -1.332e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 KIAA1143-202ENST00000484437 507 ntTSL 56.52□□□□□ -1.372e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 KARS-211ENST00000569298 589 ntTSL 26.03□□□□□ -1.442e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.452e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.52e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 SNHG8-204ENST00000602573 570 ntTSL 25.61□□□□□ -1.512e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 AC097512.1-202ENST00000503017 547 ntTSL 25.48□□□□□ -1.532e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.622e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.45□□□□□ -1.72e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.812e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.448e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.148e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.068e-7■■■■■ 38.4
LARP4Q71RC2 DENND4A-207ENST00000567323 804 ntTSL 27.03□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 38.3
LARP4Q71RC2 MZT2B-208ENST00000491178 234 ntTSL 314.7□□□□□ -0.064e-9■■■■■ 38
LARP4Q71RC2 ZNHIT1-204ENST00000492315 3958 ntTSL 28.51□□□□□ -1.051e-11■■■■■ 38
LARP4Q71RC2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.062e-21■■■■■ 37.8
LARP4Q71RC2 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.632e-21■■■■■ 37.8
LARP4Q71RC2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.136e-12■■■■■ 37.7
LARP4Q71RC2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.066e-12■■■■■ 37.7
LARP4Q71RC2 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.16e-12■■■■■ 37.7
LARP4Q71RC2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.096e-12■■■■■ 37.7
LARP4Q71RC2 CD63-209ENST00000550050 829 ntTSL 513.89□□□□□ -0.196e-12■■■■■ 37.7
LARP4Q71RC2 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.216e-12■■■■■ 37.7
LARP4Q71RC2 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.286e-12■■■■■ 37.7
LARP4Q71RC2 CD63-215ENST00000552754 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.686e-12■■■■■ 37.7
LARP4Q71RC2 CD63-212ENST00000552067 621 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.686e-12■■■■■ 37.7
LARP4Q71RC2 CD63-207ENST00000548898 727 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.686e-12■■■■■ 37.7
LARP4Q71RC2 CD63-206ENST00000548160 648 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.126e-12■■■■■ 37.7
LARP4Q71RC2 SAP18-202ENST00000450573 479 ntTSL 211.54□□□□□ -0.563e-12■■■■■ 37.5
LARP4Q71RC2 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.963e-10■■■■■ 37.3
LARP4Q71RC2 THEM6-202ENST00000518798 2279 ntTSL 216.91■□□□□ 0.33e-10■■■■■ 37.3
LARP4Q71RC2 THEM6-203ENST00000520217 551 ntTSL 312.05□□□□□ -0.483e-10■■■■■ 37.3
LARP4Q71RC2 UQCR11-205ENST00000593264 409 ntTSL 317.62■□□□□ 0.419e-12■■■■■ 37.2
LARP4Q71RC2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.484e-7■■■■■ 37.2
LARP4Q71RC2 GPHA2-201ENST00000279168 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71e-6■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.962e-8■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.922e-8■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.882e-8■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 PEMT-212ENST00000580147 708 ntTSL 320.51■□□□□ 0.872e-8■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 PEMT-211ENST00000490392 673 ntTSL 315.29■□□□□ 0.042e-8■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 PEMT-210ENST00000484838 803 ntTSL 213.99□□□□□ -0.172e-8■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-8■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 PEMT-209ENST00000477595 430 ntTSL 311.99□□□□□ -0.492e-8■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.572e-8■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 PEMT-213ENST00000582268 383 ntTSL 211.13□□□□□ -0.632e-8■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.091e-6■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 511.88□□□□□ -0.511e-6■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 SMYD3-216ENST00000492487 634 ntTSL 37.84□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.311e-6■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 SMYD3-205ENST00000453676 562 ntTSL 44.95□□□□□ -1.621e-6■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 TMX2-CTNND1-201ENST00000528395 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.754e-7■■■■■ 37.1
LARP4Q71RC2 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.324e-7■■■■■ 37
LARP4Q71RC2 ZNF37A-206ENST00000638053 4448 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.572e-6■■■■■ 36.9
LARP4Q71RC2 LINC01194-201ENST00000505196 540 ntTSL 1 (best)11.16□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 36.9
LARP4Q71RC2 LINC01194-203ENST00000513051 670 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.625e-6■■■■■ 36.9
LARP4Q71RC2 ZNF37A-201ENST00000351773 7027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.972e-6■■■■■ 36.9
LARP4Q71RC2 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 36.9
LARP4Q71RC2 DAAM1-201ENST00000360909 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.141e-6■■■■■ 36.9
LARP4Q71RC2 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.262e-6■■■■■ 36.9
LARP4Q71RC2 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 36.9
LARP4Q71RC2 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.411e-6■■■■■ 36.9
LARP4Q71RC2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.049e-12■■■■■ 36.8
LARP4Q71RC2 ATP5G1-210ENST00000515060 433 ntTSL 312.3□□□□□ -0.445e-9■■■■■ 36.7
LARP4Q71RC2 RPL9-206ENST00000504470 689 ntTSL 211.6□□□□□ -0.553e-18■■■■■ 36.7
LARP4Q71RC2 RPL9-209ENST00000511075 1028 ntTSL 27.35□□□□□ -1.233e-18■■■■■ 36.7
LARP4Q71RC2 RPL9-202ENST00000437992 579 ntTSL 45.73□□□□□ -1.493e-18■■■■■ 36.7
LARP4Q71RC2 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.32□□□□□ -2.041e-7■■■■■ 36.5
LARP4Q71RC2 SPIDR-211ENST00000519401 2090 ntTSL 211.17□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 36.5
LARP4Q71RC2 AP2S1-206ENST00000598027 355 ntTSL 25.98□□□□□ -1.452e-10■■■■■ 36.4
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