Protein–RNA interactions for Protein: Q71F23

CENPU, Centromere protein U, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPUQ71F23 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPUQ71F23 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPUQ71F23 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPUQ71F23 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CENPUQ71F23 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CENPUQ71F23 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPUQ71F23 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPUQ71F23 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CENPUQ71F23 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPUQ71F23 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPUQ71F23 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPUQ71F23 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPUQ71F23 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPUQ71F23 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPUQ71F23 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPUQ71F23 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPUQ71F23 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPUQ71F23 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPUQ71F23 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPUQ71F23 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPUQ71F23 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPUQ71F23 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPUQ71F23 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPUQ71F23 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPUQ71F23 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPUQ71F23 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPUQ71F23 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPUQ71F23 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPUQ71F23 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPUQ71F23 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPUQ71F23 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPUQ71F23 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPUQ71F23 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPUQ71F23 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPUQ71F23 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPUQ71F23 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPUQ71F23 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPUQ71F23 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPUQ71F23 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPUQ71F23 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPUQ71F23 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPUQ71F23 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CENPUQ71F23 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CENPUQ71F23 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CENPUQ71F23 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CENPUQ71F23 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms