Protein–RNA interactions for Protein: Q70JA7

CHSY3, Chondroitin sulfate synthase 3, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY3Q70JA7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHSY3Q70JA7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHSY3Q70JA7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CHSY3Q70JA7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CHSY3Q70JA7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHSY3Q70JA7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHSY3Q70JA7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHSY3Q70JA7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHSY3Q70JA7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CHSY3Q70JA7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHSY3Q70JA7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHSY3Q70JA7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHSY3Q70JA7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHSY3Q70JA7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHSY3Q70JA7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CHSY3Q70JA7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHSY3Q70JA7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHSY3Q70JA7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CHSY3Q70JA7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHSY3Q70JA7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHSY3Q70JA7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHSY3Q70JA7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHSY3Q70JA7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHSY3Q70JA7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHSY3Q70JA7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHSY3Q70JA7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CHSY3Q70JA7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHSY3Q70JA7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHSY3Q70JA7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHSY3Q70JA7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHSY3Q70JA7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHSY3Q70JA7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHSY3Q70JA7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHSY3Q70JA7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHSY3Q70JA7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHSY3Q70JA7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHSY3Q70JA7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHSY3Q70JA7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHSY3Q70JA7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHSY3Q70JA7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHSY3Q70JA7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHSY3Q70JA7 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHSY3Q70JA7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHSY3Q70JA7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms