Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
USP50Q70EL3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP50Q70EL3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP50Q70EL3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
USP50Q70EL3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
USP50Q70EL3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
USP50Q70EL3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
USP50Q70EL3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP50Q70EL3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP50Q70EL3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP50Q70EL3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP50Q70EL3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP50Q70EL3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP50Q70EL3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP50Q70EL3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP50Q70EL3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP50Q70EL3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP50Q70EL3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP50Q70EL3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP50Q70EL3 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP50Q70EL3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP50Q70EL3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP50Q70EL3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP50Q70EL3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP50Q70EL3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP50Q70EL3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP50Q70EL3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP50Q70EL3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP50Q70EL3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP50Q70EL3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP50Q70EL3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP50Q70EL3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP50Q70EL3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP50Q70EL3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP50Q70EL3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP50Q70EL3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP50Q70EL3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP50Q70EL3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
USP50Q70EL3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP50Q70EL3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
USP50Q70EL3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
USP50Q70EL3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
USP50Q70EL3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP50Q70EL3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
USP50Q70EL3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
USP50Q70EL3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP50Q70EL3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
USP50Q70EL3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP50Q70EL3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
USP50Q70EL3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP50Q70EL3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
USP50Q70EL3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP50Q70EL3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP50Q70EL3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
USP50Q70EL3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
USP50Q70EL3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP50Q70EL3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP50Q70EL3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP50Q70EL3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
USP50Q70EL3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP50Q70EL3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP50Q70EL3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP50Q70EL3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP50Q70EL3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP50Q70EL3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP50Q70EL3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP50Q70EL3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
USP50Q70EL3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
USP50Q70EL3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms