Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW05

PTCHD4, Patched domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCHD4Q6ZW05 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTCHD4Q6ZW05 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCHD4Q6ZW05 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCHD4Q6ZW05 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTCHD4Q6ZW05 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCHD4Q6ZW05 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTCHD4Q6ZW05 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTCHD4Q6ZW05 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCHD4Q6ZW05 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCHD4Q6ZW05 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTCHD4Q6ZW05 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTCHD4Q6ZW05 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTCHD4Q6ZW05 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTCHD4Q6ZW05 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PTCHD4Q6ZW05 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTCHD4Q6ZW05 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTCHD4Q6ZW05 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCHD4Q6ZW05 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCHD4Q6ZW05 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTCHD4Q6ZW05 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCHD4Q6ZW05 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCHD4Q6ZW05 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTCHD4Q6ZW05 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCHD4Q6ZW05 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCHD4Q6ZW05 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTCHD4Q6ZW05 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCHD4Q6ZW05 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTCHD4Q6ZW05 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms