Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM47EQ6ZV65 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM47EQ6ZV65 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM47EQ6ZV65 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM47EQ6ZV65 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM47EQ6ZV65 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM47EQ6ZV65 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM47EQ6ZV65 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM47EQ6ZV65 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM47EQ6ZV65 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM47EQ6ZV65 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM47EQ6ZV65 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM47EQ6ZV65 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM47EQ6ZV65 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM47EQ6ZV65 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM47EQ6ZV65 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM47EQ6ZV65 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM47EQ6ZV65 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM47EQ6ZV65 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM47EQ6ZV65 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM47EQ6ZV65 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms