Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BEND4Q6ZU67 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BEND4Q6ZU67 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BEND4Q6ZU67 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
BEND4Q6ZU67 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BEND4Q6ZU67 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BEND4Q6ZU67 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms