Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR7

LRRC9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC9Q6ZRR7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
LRRC9Q6ZRR7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
LRRC9Q6ZRR7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
LRRC9Q6ZRR7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.26
LRRC9Q6ZRR7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
LRRC9Q6ZRR7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
LRRC9Q6ZRR7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
LRRC9Q6ZRR7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
LRRC9Q6ZRR7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
LRRC9Q6ZRR7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
LRRC9Q6ZRR7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
LRRC9Q6ZRR7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
LRRC9Q6ZRR7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
LRRC9Q6ZRR7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
LRRC9Q6ZRR7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC41.55■■■■■ 4.24
LRRC9Q6ZRR7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
LRRC9Q6ZRR7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
LRRC9Q6ZRR7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
LRRC9Q6ZRR7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
LRRC9Q6ZRR7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
LRRC9Q6ZRR7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
LRRC9Q6ZRR7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.53■■■■■ 4.24
LRRC9Q6ZRR7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
LRRC9Q6ZRR7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
LRRC9Q6ZRR7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
LRRC9Q6ZRR7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
LRRC9Q6ZRR7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
LRRC9Q6ZRR7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
LRRC9Q6ZRR7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
LRRC9Q6ZRR7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
LRRC9Q6ZRR7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
LRRC9Q6ZRR7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC41.46■■■■■ 4.23
LRRC9Q6ZRR7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
LRRC9Q6ZRR7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
LRRC9Q6ZRR7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
LRRC9Q6ZRR7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
LRRC9Q6ZRR7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.43■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC41.42■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC41.39■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
LRRC9Q6ZRR7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
LRRC9Q6ZRR7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
LRRC9Q6ZRR7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
LRRC9Q6ZRR7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
LRRC9Q6ZRR7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
LRRC9Q6ZRR7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.34■■■■■ 4.21
LRRC9Q6ZRR7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
LRRC9Q6ZRR7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
LRRC9Q6ZRR7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
LRRC9Q6ZRR7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
LRRC9Q6ZRR7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC41.33■■■■■ 4.21
LRRC9Q6ZRR7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
LRRC9Q6ZRR7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
LRRC9Q6ZRR7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
LRRC9Q6ZRR7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
LRRC9Q6ZRR7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
LRRC9Q6ZRR7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.3■■■■■ 4.2
LRRC9Q6ZRR7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
LRRC9Q6ZRR7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
LRRC9Q6ZRR7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
LRRC9Q6ZRR7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
LRRC9Q6ZRR7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
LRRC9Q6ZRR7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
LRRC9Q6ZRR7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.2
LRRC9Q6ZRR7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC41.25■■■■■ 4.19
LRRC9Q6ZRR7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.25■■■■■ 4.19
LRRC9Q6ZRR7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
LRRC9Q6ZRR7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
LRRC9Q6ZRR7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
LRRC9Q6ZRR7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
LRRC9Q6ZRR7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
LRRC9Q6ZRR7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
LRRC9Q6ZRR7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
LRRC9Q6ZRR7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.21■■■■■ 4.19
LRRC9Q6ZRR7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
LRRC9Q6ZRR7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
LRRC9Q6ZRR7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
LRRC9Q6ZRR7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC41.19■■■■■ 4.18
LRRC9Q6ZRR7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
LRRC9Q6ZRR7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
LRRC9Q6ZRR7 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
LRRC9Q6ZRR7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
LRRC9Q6ZRR7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
LRRC9Q6ZRR7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
LRRC9Q6ZRR7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
LRRC9Q6ZRR7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
LRRC9Q6ZRR7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms